Loading the map…
| Player | Team | Goals |
|---|---|---|
| E. Õunapuu | Nõmme United | 32 |
| G. Lehtmets | Viimsi | 25 |
| J. Demidov | Nõmme United | 25 |
| K. Nesterov | FC Tallinn | 18 |
| H. Leoke | Nõmme United | 16 |
| M. Orlov | K-Järve JK Järve | 16 |
| P. Klein | JK Tabasalu | 16 |
| J. Põder | JK Tabasalu | 15 |
| M. Eenmaa | Flora II | 14 |
| M. Skvortsov | FCI Levadia II | 14 |
| T. Varjund | Flora II | 12 |
| A. Šapovalov | Flora II | 11 |
| A. Taar | FC Tallinn | 11 |
| A. Nahk | JK Tabasalu | 10 |
| A. Paju | Elva | 10 |
| D. Ruus | Legion | 10 |
| P. Kristal | FCI Levadia II | 10 |
| B. Vain | Flora II | 9 |
| J. Reilson | Elva | 9 |
| O. Mägi | Viimsi | 8 |
| S. Soo | Paide II | 8 |
| T. Pajo | JK Tabasalu | 8 |
| E. Golovljov | FC Tallinn | 7 |
| G. Rõivassepp | Flora II | 7 |
| N. Grankin | FCI Levadia II | 7 |
| S. Aer | Paide II | 7 |
| V. Velikanov | K-Järve JK Järve | 7 |
| A. Švedovski | Nõmme United | 6 |
| F. Annion | JK Tabasalu | 6 |
| M. Jumankin | FC Tallinn | 6 |