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| Player | Team | Goals |
|---|---|---|
| R. Hennings | Karlsruher SC | 17 |
| S. Terodde | VfL Bochum | 16 |
| F. Niederlechner | 1. FC Heidenheim | 15 |
| S. Polter | Union Berlin | 14 |
| C. Benschop | Fortuna Düsseldorf | 13 |
| R. Okotie | TSV 1860 München | 13 |
| M. Schnatterer | 1. FC Heidenheim | 11 |
| Y. Yurary | RB Leipzig | 11 |
| J. Pohjanpalo | Fortuna Düsseldorf | 11 |
| E. Kapllani | FSV Frankfurt | 11 |
| J. Sylvestr | 1. FC Nürnberg | 9 |
| D. Stroh-Engel | SV Darmstadt 98 | 9 |
| S. Šesták | VfL Bochum | 9 |
| S. Lex | FC Ingolstadt 04 | 9 |
| A. Bouhaddouz | SV Sandhausen | 9 |
| L. Hinterseer | FC Ingolstadt 04 | 9 |
| M. Liendl | Fortuna Düsseldorf | 8 |
| D. Kaiser | RB Leipzig | 8 |
| R. Leipertz | 1. FC Heidenheim | 8 |
| A. Wooten | SV Sandhausen | 8 |
| H. Nielsen | Eintracht Braunschweig | 8 |
| P. Groß | FC Ingolstadt 04 | 7 |
| V. Grifo | FSV Frankfurt | 7 |
| D. Kreilach | Union Berlin | 7 |
| M. Leckie | FC Ingolstadt 04 | 7 |
| M. Gregoritsch | VfL Bochum | 7 |
| Z. Dedič | FSV Frankfurt | 7 |
| H. Yamada | Karlsruher SC | 6 |
| J. Gjasula | VfR Aalen | 6 |
| R. Brégerie | SV Darmstadt 98 | 6 |