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| Player | Team | Goals |
|---|---|---|
| D. Selke | Hamburger SV | 22 |
| M. Kaars | 1. FC Magdeburg | 19 |
| F. Asllani | SV Elversberg | 18 |
| R. Ache | 1. FC Kaiserslautern | 18 |
| M. Sylla | Schalke 04 | 16 |
| R. Philippe | Eintracht Braunschweig | 14 |
| I. Lidberg | SV Darmstadt 98 | 14 |
| R. Königsdörffer | Hamburger SV | 14 |
| M. Wanitzek | Karlsruher SC | 13 |
| D. Kownacki | Fortuna Düsseldorf | 13 |
| K. Karaman | Schalke 04 | 13 |
| B. Zivzivadze | Karlsruher SC | 12 |
| F. Hornby | SV Darmstadt 98 | 12 |
| S. Tzimas | 1. FC Nürnberg | 12 |
| S. Telalović | SSV Ulm 1846 | 12 |
| Í. Jóhannesson | Fortuna Düsseldorf | 11 |
| F. Reese | Hertha BSC | 11 |
| N. Futkeu | SpVgg Greuther Fürth | 11 |
| T. Lemperle | FC Cologne | 10 |
| D. Downs | FC Cologne | 10 |
| M. Emreli | 1. FC Nürnberg | 10 |
| R. Glatzel | Hamburger SV | 10 |
| J. Dompé | Hamburger SV | 9 |
| F. Bilbija | Paderborn | 9 |
| M. Damar | SV Elversberg | 9 |
| J. Mees | Preußen Münster | 9 |
| J. Justvan | 1. FC Nürnberg | 8 |
| D. Hanslik | 1. FC Kaiserslautern | 8 |
| K. Corredor | SV Darmstadt 98 | 8 |
| A. Grimaldi | Paderborn | 8 |