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| Player | Team | Goals |
|---|---|---|
| D. Milic | Illertissen | 12 |
| S. Bahar | Buchbach | 8 |
| E. Qenaj | Illertissen | 7 |
| F. Bachschmid | Wacker Burghausen | 7 |
| F. Niederlechner | TSV 1860 München | 7 |
| A. Heinz | Bayern München II | 6 |
| A. Junger | Vilzing | 6 |
| B. Assomo | Bayern München II | 6 |
| M. Eberwein | TSV 1860 München | 6 |
| M. Schafer | Schwaben Augsburg | 6 |
| T. Heiland | Buchbach | 6 |
| T. Stossberger | Buchbach | 6 |
| A. Kuqanaj | Eichstätt | 5 |
| C. Kresin | Memmingen | 5 |
| D. Dreo | Augsburg II | 5 |
| D. Gunes | Greuther Fürth II | 5 |
| E. Ozbay | Vilzing | 5 |
| E. Shaqiri | Bayreuth | 5 |
| J. Krupa | SpVgg Unterhaching | 5 |
| J. Skowronek | Nürnberg II | 5 |
| L. Husic | Augsburg II | 5 |
| M. Sodji | Wacker Burghausen | 5 |
| M. Ziereis | Vilzing | 5 |
| N. Doll | Bayreuth | 5 |
| N. S. Agbaje | Wacker Burghausen | 5 |
| P. Scheder | Bayreuth | 5 |
| S. Sturm | Aubstadt | 5 |
| A. Calderon | TSV 1860 München | 4 |
| A. Malaj | Augsburg II | 4 |
| B. Bahn | Augsburg II | 4 |