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| Player | Team | Goals |
|---|---|---|
| J. Ulbricht | SV Meppen | 27 |
| M. Facklam | VfB Oldenburg | 25 |
| M. Boakye | Hamburger SV II | 23 |
| L. G. Schmidt | Bremer SV | 22 |
| T. Steffens | Kickers Emden | 20 |
| P. Harant | Schöningen | 17 |
| O. Schmitt | SV Meppen | 16 |
| T. Hobrecht | Hannover 96 II | 15 |
| H. Hyseni | SV Drochtersen/Assel | 14 |
| M. Wegner | SSV Jeddeloh | 14 |
| F. Kiszka | HSC Hannover | 13 |
| K. Ghawilu | SSV Jeddeloh | 13 |
| A. Verinac | VfB Lübeck | 12 |
| L. Kruger | Eintracht Norderstedt | 12 |
| T. Gaida | SSV Jeddeloh | 12 |
| C. Rocker | Werder Bremen II | 11 |
| J. Wulff | SV Drochtersen/Assel | 11 |
| M. Cornils | Weiche Flensburg | 11 |
| M. Eickhoff | Kickers Emden | 11 |
| S. Engelmann | SV Meppen | 11 |
| A. Inaka | Phönix Lübeck | 10 |
| R. Brand | VfB Oldenburg | 10 |
| A. Vogel | Hannover 96 II | 9 |
| M. Faleu | Weiche Flensburg | 9 |
| P. Mbock | Werder Bremen II | 9 |
| T. Deters | SV Meppen | 9 |
| A. A. Hamid | SV Drochtersen/Assel | 8 |
| B. Luis | Phönix Lübeck | 8 |
| D. Hartmann | Weiche Flensburg | 8 |
| D. Schiller | Kickers Emden | 8 |