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| Player | Team | Goals |
|---|---|---|
| João Carlos | Academica | 17 |
| B. Róchez | Nacional | 15 |
| D. Loader | FC Porto B | 14 |
| Henrique Araújo | Benfica B | 14 |
| Diogo Pinto | Estrela | 13 |
| Wellington Carvalho | Chaves | 13 |
| S. Petkov | Feirense | 12 |
| A. Yakubu | Rio Ave | 11 |
| Jota | Casa Pia | 11 |
| Nenê | Vilafranquense | 11 |
| Bruno Almeida | Trofense | 10 |
| Pedro Mendes | Rio Ave | 10 |
| Roberto | Penafiel | 10 |
| S. Godwin | Casa Pia | 10 |
| Tiago Gouveia | Benfica B | 10 |
| D. Nussbaumer | Academico Viseu | 9 |
| M. Achouri | Trofense | 9 |
| Pedro Henrique | Farense | 9 |
| Heliardo | Varzim | 8 |
| João Camacho | Nacional | 8 |
| Luis Lopes | Benfica B | 8 |
| A. Sapara | Leixoes | 7 |
| Batxi | Chaves | 7 |
| Fábio Espinho | Feirense | 7 |
| Gui Ferreira | Mafra | 7 |
| João Teixeira | Chaves | 7 |
| K. Vargas | Feirense | 7 |
| M. Belkheir | Vilafranquense | 7 |
| P. Ayongo | Academico Viseu | 7 |
| Cristian Ponde | Farense | 6 |